การหาลำดับจีโนมของแรดดำสามารถช่วยเผ่าพันธุ์จากการสูญพันธุ์

ศตวรรษที่ 21 เป็นช่วงเวลาที่วิเศษในการเป็นนักชีววิศวกรรมและเป็นช่วงเวลาที่น่ากลัวที่จะเป็นแรดดำ สายพันธุ์แอฟริกันซึ่งมีหมายเลข 850,000 ศตวรรษที่ผ่านมาได้รับการ whittled เพื่อประชากรลดลงอย่างรวดเร็วประมาณ 5,000 ด้วยความหวังว่าวันหนึ่งจะย้อนกลับไปสู่การลดลงของความหายนะครั้งนี้นักชีววิทยาพยายามที่จะจัดลำดับของ diceros bicornis bicornis จีโนม

โครงการนี้เป็นความร่วมมือระหว่างผู้เชี่ยวชาญด้านเทคโนโลยีชีวภาพที่มีความคิดอนุรักษ์เช่นนักพยาธิวิทยามหาวิทยาลัยวอชิงตันและนักชีววิศวกรรมดร. ชาร์ลส์เมอร์เรย์และแมทธิวมาร์คัสซีอีโอของ Pembient Pembient เป็น บริษัท เทคโนโลยีชีวภาพในซานฟรานซิสโกที่ต้องการเจาะตลาดจีนด้วยการสังเคราะห์ - แต่เหมือนกันทางชีวภาพ - ฮอร์นแรด, 3D พิมพ์จากเคราตินที่ทำในห้องปฏิบัติการและอาจส่งเป็นเบียร์แรด (เคราตินเป็นสิ่งที่เล็บของคุณและเขาแรดทำจากมันไม่ได้มีมนต์ขลังหรือเป็นยา) เพมเพนเรียนรู้จากจีโนมของแรดเดี่ยวที่มีชื่อว่า Ntombi ได้มากมาร์คัสบอก ผกผัน เพื่อปรับแต่งวิธีการสังเคราะห์โปรตีนแรด

แต่ก่อนที่จะมีใครสามารถขุดพันธุศาสตร์ของ Ntombi เพื่อหาข้อมูลจีโนมแรดดำจะต้องได้รับการจัดลำดับก่อน โครงการประมาณครึ่งทางที่จะระดมทุน $ 16,500 บน Experiment.com ซึ่งเป็นแพลตฟอร์มคราวด์ฟันดิ้งประเภทหนึ่งเช่น Kickstarter ยกเว้นสาขาวิทยาศาสตร์แทนที่จะเป็นเกมแทนที่การฟื้นคืนชีพของวิดีโอเกมที่มีมานาน

“ ยังมีสิ่งมีชีวิตอยู่ค่อนข้างน้อยที่จีโนมได้รับการจัดลำดับแล้ว” เมอเรย์กล่าว “ จนกระทั่งเมื่อไม่นานมานี้สิ่งนี้ยากมาก - ใช้เวลานานและมีราคาแพง”

ไม่ได้หมายความว่าสัตว์จะไม่ทำให้จีโนมของพวกเขาสำเร็จ โครงการจีโนม 10K มีวัตถุประสงค์เพื่อรวบรวมหีบทางพันธุกรรมของโนอาห์ และแรดขาวทางใต้ซึ่งเป็นสายพันธุ์ที่มีประชากรมากกว่าและใหญ่กว่าได้มีการจัดลำดับจีโนมในปี 2012 แต่แรดดำอย่าง Ntombi ล่ะ? “ ยังไม่ชัดเจนว่าทำไมแรดดำจึงถูกทิ้งไว้ที่ด้านข้างเป็นเวลานาน” มาร์คัสกล่าว เขาชอล์คละเลยสิ่งที่เกิดขึ้น; แต่อาจเป็นไปได้ว่าเนื่องจากคนผิวขาวทางตอนใต้ได้รับการจัดลำดับแล้วแรดสีดำจึงไม่ได้รับความสำคัญ

Markus, Murray และผู้ทำงานร่วมกันของพวกเขามุ่งที่จะเสียบช่องว่างนั้น Ntombi แรดโปสเตอร์สำหรับโครงการได้รับการเจาะเลือดและเก็บรักษา - และบิงโก! ดีเอ็นเอแรด การเรียงลำดับควรจะตรงไปตรงมาค่อนข้างเมอเรย์กล่าวว่า “ มันเป็นความช่วยเหลือที่ยิ่งใหญ่ที่จะมีจีโนมแรดขาวเป็นมาตรฐาน”

ขั้นตอนต่อไปในลำดับ

ด้วย DNA ของ Ntombi ที่โฮสต์อยู่บนเซิร์ฟเวอร์ของ DNAnexsus นักชีววิทยาจะวางรากฐานสำหรับฟังก์ชั่นแรดแบบเปรียบเทียบ “ เมื่อเราได้ลำดับของเธอเราสามารถเริ่มเข้าใจว่าอะไรทำให้แรดเป็นแรดสีขาวแตกต่างจากสีดำ” เมอเรย์ย์กล่าว“ และให้ข้อมูลที่จะช่วยติดตามตัวอย่างตุ๋น”

สัตวแพทย์สามารถตรวจหายีนที่ทำให้เกิดโรคได้และมีพื้นฐานในการเปรียบเทียบแรดดำอีกเจ็ดสายพันธุ์ซึ่งสามสายพันธุ์นั้นสูญพันธุ์ไปแล้ว

สัตว์หลังจากวันพรุ่งนี้

เมื่อเรามีความเข้าใจที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับพันธุศาสตร์แรดดำประตูทางทฤษฎีหลายแห่งก็เปิดออก “ ไปตามถนนฉันตื่นเต้นกับการใช้เซลล์ต้นกำเนิดเพื่อทำความเข้าใจกับสรีรวิทยาของแรดและเพื่อพัฒนาเขาแรดในห้องแล็บเพื่อลดการรุกล้ำ” เมอเรย์กล่าว

มาร์คัสคาดการณ์อีกเล็กน้อย สำหรับ diceros bicornis bicornis มาร์คัสไม่ได้มองเห็นการสูญพันธุ์ของแมมมอ ธ ในรูปแบบการสูญพันธุ์ แต่ย้อนกลับไปที่นาฬิกาพันธุกรรม ประชากรที่เล็กลงจะมีโอกาสเกิดปัญหามากขึ้น

และสำหรับแรดดำที่หายไปแล้ว? เขาเปรียบเทียบความพยายามนี้กับการจัดลำดับจีโนมแรดขาวภาคเหนือโครงการต่อเนื่องที่สวนสัตว์ซานดิเอโก มีการพูดคุยกันถึงความพยายามในการรับแรดขาวทางใต้ (ซึ่งมี 20,000) เพื่อดำเนินการแรดขาวเหนือ (ซึ่งมี 5) เป็นคำ มาร์คัสพูดด้วยการมองโลกในแง่ดีอย่างระมัดระวังและระมัดระวัง:“ อาจเป็นไปได้ - อาจเป็นไปได้ว่าสายพันธุ์แรดดำที่สูญพันธุ์อาจถูกนำกลับมามีชีวิตอีกครั้ง”